學校設有3個博士後科研流動站（交通運輸工程🧑🔧🧦、電氣工程、管理科學與工程）🧑🏿🦰，4個一級學科博士點（交通運輸工程🏊、管理科學工程📃、船舶與海洋工程🎅🏿、電氣工程），17個二級學科博士點，17個一級學科碩士學位授權點，64個二級學科碩士學位授權點🦶🏿，13個專業學位授權類別👩🏻🏭，52個本科專業。擁有18個省部級重點研究基地。現有1個國家重點（培育）學科，1個上海市高峰學科🍎，2個上海市高原學科💆🏿♀️，9個部市級重點學科，工程學、計算機科學和社會科學總論3個學科進入ESI全球前1%,港航物流學科保持全球領先。5個國家級特色專業，1個國家級綜合改革試點專業🔭🔇，15個國家級一流本科專業建設點，6個教育部卓越工程師教育培養計劃專業，17個上海市本科教育高地。現有2個國家級實驗教學示範中心🌸，2個國家級虛擬仿真實驗教學示範中心，5個國家級實踐教學示範中心⏮，1個全國示範性工程專業學位研究生聯合培養基地。設有水上訓練中心，擁有4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪👨🏿🍼。
在2004年教育部本科教學工作水平評估和2006年教育部英語專業教學評估中獲得優秀💂♀️👰🏽。近年來，科技服務能力不斷提升，獲一批國家級科研項目及部市級以上科技進步獎㊗️。
實行校院二級管理體製📤，現設有商船學院、交通運輸學院、經濟管理學院（上海高級國際航運學院🧁、亞洲郵輪學院）⏩🍿、物流工程學院（中荷機電工程學院）、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋科學與工程學院、理學院、徐悲鴻藝術學院、馬克思主義學院、物流科學與工程研究院、體育教學部、國際教育學院、繼續教育學院👨🦳🤶🏿、上海港灣學校等二級辦學部門。在27000余名學生中🕺🏿，有全日製本科生近16000人🕵🏽♂️，各類在校研究生近8000人🚓，留學生900余人。在近1300名專任教師中🐚，有教授近190名。學校致力於培養國家航運業所需要的各級各類專門人才📉，已向全國港航企事業單位及政府部門輸送了逾19萬畢業生🤢，被譽為“高級航運人才的搖籃”🏤。
